Ікаріїн і конкуруюча ендогенна мережа РНК: потенційна захисна стратегія проти гострого ураження нирок, викликаного контрастом.

PMID: Drug Des Devel Ther. 2022; 16: 2343-2363. Epub 2022, 23 липня. PMID: 35910780 Назва анотації: Ікаріїн і конкуруюча мережа ендогенної РНК: потенційна захисна стратегія проти гострого ураження нирок, викликаного контрастом. Анотація: ДОвідкова інформація: Ікаріїн має захисну дію при деяких захворюваннях нирок. Однак роль ікаріїну в гострому ураженні нирок, спричиненому контрастом (CIAKI), досі не з’ясована. Це дослідження мало на меті дослідити вплив ікаріїну на CIAKI, а також дослідити основний механізм з точки зору взаємодії між генами, що кодують білок, і некодуючими РНК. МЕТОДИ: Ефект ікаріїну оцінювали як in vivo, так і in vitro Моделі CIAKI. Нирки щурів збирали для повногогеномного секвенування. Диференційовано експресовані гени (DEG) перевіряли та візуалізували за допомогою програмного забезпечення R. Функціональна анотація DEG була проаналізована Metascape. За допомогою програмного забезпечення Cytoscape було сконструйовано конкуруючу мережу ендогенної РНК (ceRNA) і відібрано гени-концентратори. Експресії хаб-генів перевіряли за допомогою ПЛР. Було також досліджено асоціацію генів-концентраторів у мережі цеРНК і функції нирок. РЕЗУЛЬТАТИ: Ікаріїн захищав від CIAKI як у моделях in vivo, так і in vitro. На основі DEG у щурів CIAKI, попередньо оброблених ікарином, були сконструйовані мережі цеРНК, асоційовані з lncRNA та circRNA, відповідно. Функціональна анотація показала, що мережі ceRNA були збагачені каскадом ERK1 і ERK2, сигналізацією MAPK і сигналізацією NF-κB. Крім того, дві circRNA, шість lncRNA, чотири miRNA і дев’ять мРНК були обрані як концентраційні гени мережі ceRNA. Серед них вісім мРНК (Acot1, Cbwd1, Ly6i, Map3k14, Mettl2b, Nyap1, Set і Utp20) негативно корелювали з функцією нирок, тоді як одна мРНК (Tmem44) позитивно корелювала з функцією нирок. ВИСНОВОК: Ікаріїн продемонстрував захисну дію проти CIAKI. Мережа ceRNA, що включає Acot1, Cbwd1, Ly6i, Map3k14, Mettl2, Nyap1, Set, Tmem44 і Utp20, може частково сприяти базовому механізму захисту ікаріїну шляхом регулювання каскаду ERK1 і ERK2, сигналізації MAPK і сигналізації NF-κB.

читати далі

Leave a Comment