Молекулярний докінг-аналіз та оцінка антимікробних властивостей компонентів Geranium wallichianum.

PMID: Sci Rep. 2022, 22 липня; 12 (1): 12547. Epub 2022, 22 липня. PMID: 35869098 Назва анотації: Молекулярний докінг-аналіз та оцінка антимікробних властивостей компонентів Geranium wallichianum D. Don ex Sweet з Кашміру Гімалаї. Анотація: Geranium wallichianum D. Don ex Sweet — добре відома лікарська рослина в Кашмірі Гімалії. Докази його сучасного застосування в медицині залишаються майже невивченими. Це дослідження було проведено для з’ясування детальних антимікробних можливостей різних сирих екстрактів (метанольного, етанольного, петролейного ефіру та етилацетату) G. wallichainum проти звичайних бактеріальних і грибкових патогенів людини з метою наукового підтвердження його традиційного використання. РХ-МС аналіз G. wallichainum дав 141 біоактивну сполуку, переважна більшість із яких має терапевтичне застосування. Визначення мінімальних інгібуючих концентрацій (МІК) методом мікророзведення бульйону G. wallichainum було протестовано проти бактеріальних і грибкових патогенів з МІК у діапазоні від 0,39 до 400 мкг/мл. Крім того, скринінг віртуальних лігандів дозволив виявити елатин, кемпферол і гермакрен-А як найбільш активні з медичної точки зору компоненти та потенційні інгібітори пеніцилінзв’язуючого білка (PBP), дигідроптероатсинтази (DHPS), фактора елонгації-Tu (Eu-Tu), транспортера ABC , 1,3-бета-глікан і бета-тубулін. Графіки середньоквадратичного відхилення (RMSD), отримані за допомогою молекулярно-динамічного моделювання (MDS), показали справжні зв’язувальні взаємодії, які були додатково перевірені за допомогою графіків середньоквадратичного відхилення (RMSF), які забезпечили краще розуміння амінокислот, присутніх у білках, відповідальних за для молекулярних рухів і коливань. Ефективне зв’язування елатину, кемпферолу та гермакрену-А з цими білками забезпечує основу для подальших досліджень, щоб зрозуміти основний механізм, який припиняє ріст цих мікробів.

читати далі

Leave a Comment