Моделі епідеміології та прогнозування COVID-19

Ешлі Туіт математичне моделювання інфекційних захворювань обговорює фактори, що передбачають поширення SARS CoV-2, моделі прогнозування та вирівнювання кривої COVID-19. Чи може вірус COVID-19 мутувати? І якщо це станеться, які найімовірніші наслідки? Що показують моделі прогнозування щодо того, як довго триватиме ця пандемія? Чи ймовірно буде другий пік?…

Створення подкастів, звукове оформлення та монтаж Антона Гельмана

Письмове резюме та публікація в блозі Антона Хельмана, березень 2020 р

Цитувати цей подкаст як: Гельман, А. Туйт, А. Епізод 141 COVID-19, частина 5 – Епідеміологія та моделі прогнозування. Випадки невідкладної медицини. Березень 2020 р. https://emergencymedicinecases.com/covid-19-epidemiology-prediction-models. Доступ [date]

Цей подкаст і публікація в блозі засновані на доказах рівня C – консенсусі та експертній думці. Приклади протоколів, контрольних списків і алгоритмів призначені для освітніх цілей і потребують модифікації для ваших конкретних потреб, а також схвалення вашої лікарні перед використанням у клінічній практиці.

Основні епідеміологічні вимірювання COVID-19

На основі систематичного огляду, опублікованого 31 березня, поточні дані свідчать про наступні ключові епідеміологічні вимірювання COVID-19:

  • Час подвоєння: 3-7 днів, щоб епідемія подвоїлася
  • Номер репродукції – Р0 (кількість очікуваних вторинних випадків, що виникають від однієї особи, міра передачі захворювання): коливається від 1,9 до 6,5, ймовірно, між 2,0 і 3,0 (порівняно з SARS-CoV, спалахом HINI і трохи більше, ніж сезонний грип, який вважається приблизно 1,5)
  • Інкубаційний період: 4-6 днів (подібно до SARS Co-V та MERS)
  • Послідовний інтервал: 4-8 днів
  • Летальність: від 0,3% до 1,4% (за межами Китаю)
  • Тривалість виділення вірусу: сильно варіює від 8 до 37 днів (рівень РНК вірусу може бути вищим рано після появи симптомів)

Актуальна інтерактивна карта Університету Джона Хопкінса який відстежує глобальну передачу.

Чи може SARS Co-V2 мутувати та стати більш вірулентним? Чи є імунітет після перенесеної інфекції?

Коли РНК-вірус SARS Co-V реплікується, він дуже схильний до помилок, тому він мутує, за оцінками, швидкість мутацій становить 1-2 на місяць (повільніше, ніж грип), однак більшість мутацій будуть нейтральними та не впливатимуть на поведінку вірусу. Вірус, ймовірно, буде відносно стабільним протягом наступних кількох місяців і навряд чи мутуватиме в більш вірулентний і смертельний вірус, і ми, ймовірно, зможемо розробити ефективну вакцину протягом 15-18 місяців. Слабкі докази свідчать про те, що деякі антитіла, які індукуються у хворих на COVID-19, є захисними, але невідомо, чи в усіх інфікованих пацієнтів виникає захисна імунна відповідь і як довго може тривати захисний ефект.

За даними CDC, незрозуміло, чи існує імунітет після інфікування.

  • Постінфекційний імунітет може виникнути, але це не доведено
  • Незрозуміло, як довго зберігається імунітет, оскільки може виникнути антигенний дрейф
  • Багато фахівців-вірусологів вважають, що у пацієнтів, які одужали (включаючи медичних працівників), буде принаймні короткочасний імунітет

Які профілактичні заходів найбільше допомагає стримувати передачу SARS-CoV2?

Один із рушіїв тиражного номера – Р0 це кількість контактів кожного з людей у ​​регіоні за день. Комбінована стратегія дистанціювання на робочому місці, карантину (і меншою мірою), закриття шкіл і обстеження в аеропорту, здається, є дуже ефективною для стримування поширення, однак ефективність цих заходів контролю може бути знижена значною частиною безсимптомних пацієнтів (17,9). %) та передсимптоматична передача (12,1%).

Чуйний план соціального дистанціювання

Згідно з моделями математичних прогнозів Університету Торонто, у найгіршому випадку (обмежені заходи для стримування передачі та мінімальне тестування), 50-70% населення Онтаріо заразиться вірусом, а необхідна кількість ліжок у реанімації буде у 20 разів більша, ніж зараз максимальна місткість. Суворе соціальне дистанціювання повинно діяти протягом 6-12 місяців, щоб зупинити передачу. Однак, якщо ми адаптуємо гнучкий план, за яким ми спочатку використовуємо соціальне дистанціювання протягом кількох тижнів, а потімчуйне соціальне дистанціювання або поетапне повернення на роботу/навчання (тригером для соціального дистанціювання є Місткість ліжка реанімації), математична модель передбачала б, що рівень захворюваності буде достатньо низьким, щоб ми могли безпечно повернутися до роботи/навчання (принаймні частково).

Дослідження спалаху COVID-19 у Китаї показало, що заходи соціального дистанціювання були найефективнішими, якщо поступове повернення на роботу відбувалося через 3-4 місяці після початку спалаху. Очевидно поступове повернення до роботи через цей проміжок часу знизило середню кількість інфекцій більш ніж на 92%.

Заходи спільноти для пом’якшення поширення COVID-19 у Канаді – Уряд Канади

Початкове суворіше соціальне дистанціювання та ізоляція симптоматичних пацієнтів «згладить криву» і виграє нам час для збільшення ресурсів і збільшення можливостей охорони здоров’я для задоволення потреб:

  • Купуйте більше вентиляторів
  • Відкрити респіраторні ізолятори
  • Запас ЗІЗ
  • Інтеграція телемедицини
  • Розширити потужності лабораторії для тестування
  • Навчіть служб екстреної допомоги
  • Дізнайтеся більше від колег у гарячих точках

Чи ймовірно буде 2-й пік? Чи є COVID-19 сезонним захворюванням?

Невідомо, чи пом’якшить літо поширення CoV-2 у північній півкулі. Якщо він послаблюється в теплу погоду, восени може спостерігатися другий пік, подібний до SARS CoV-1. Другий пік також може статися, якщо заходи соціального дистанціювання, які були скасовані, не будуть застосовані досить скоро після того, як рівень випадків почне зростати.

Список літератури

  1. Ліпсітч М., Свердлоу Д.Л., Фінеллі Л. Визначення епідеміології Covid-19 – необхідні дослідження. N Engl J Med. 2020;382(13):1194-1196.
  2. Prem K, Liu Y, Russell TW та ін. Вплив стратегій контролю для зменшення соціального змішування на результати епідемії COVID-19 в Ухані, Китай: дослідження моделювання. Lancet Public Health. 2020 рік;
  3. Парк, М.; Кук, А.Р.; Лім, Дж. Т.; Сонце, Ю.; Діккенс, Б.Л. Систематичний огляд епідеміології COVID-19 на основі сучасних даних. Дж. Клін. Мед. 2020 рік, 9967.
  4. Мізумото, К.; Кагая, К.; Заребський, А.; Човелл, Г. Оцінка частки безсимптомних випадків коронавірусної хвороби 2019 (COVID-19) на борту круїзного лайнера Diamond Princess, Йокогама, Японія, 2020. Євроспостереження 2020 рік, 25.
  5. Ду, З.; Ван, Л.; Сюй, X.; Ву, Ю.; Каулінг, BJ; Мейєрс, Луїзіана. Серійний інтервал COVID-19 із загальнодоступних підтверджених випадків. medRxiv 2020 рік.
  6. Нішіура, Х.; Лінтон, Н.М.; Ахметжанов А. Р. Серійний інтервал інфікування новим коронавірусом (2019-nCoV). medRxiv 2020 рік.
  7. Національний центр імунізації та респіраторних захворювань (NCIRD), відділ вірусних захворювань. Коронавірусна хвороба 2019 (COVID-19). Медичні працівники: поширені запитання та відповіді. Веб-сайт організації CDC 24-7. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/hcp/faq.html Опубліковано/оновлено 21 лютого 2020 р. Оновлено 22 березня 2020 р. Переглянуто 30 березня 2020 р.
  8. Грінфілдбойс, Н. Чи отримуєте ви імунітет після одужання від випадку коронавірусу? 20 березня 2020 р. https://www.npr.org/sections/goatsandsoda/2020/03/20/819038431/do-you-get-immunity-after-recovering-from-a-case-of-coronavirus. Доступ 28 березня 2020 р.
  9. Дель Ріо С, Малані П.Н. COVID-19 – нові відомості про епідемію, яка швидко змінюється [published online ahead of print, 2020 Feb 28]. ДЖАМА. 2020;10.1001/jama.2020.3072. doi:10.1001/jama.2020.3072.
  10. Li Q, Guan X, Wu P та ін. Рання динаміка передачі нової інфікованої коронавірусом пневмонії в Ухані, Китай [published online ahead of print, 2020 Jan 29]. N Engl J Med. 2020;10.1056/NEJMoa2001316. doi:10.1056/NEJMoa2001316.
  11. Звіт Спільної місії ВООЗ і Китаю з коронавірусної хвороби 2019 (COVID-2019). 16-24 лютого 2020 р. http://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/who-china-joint-mission-on-covid-19-final-report.pdf (Дата перегляду 4 березня 2020).
  12. Liu Y, Yan LM, Wan L та ін. Вірусна динаміка при легких та важких випадках COVID-19. Lancet Infect Dis 2020.
  13. Rothe C, Schunk M, Sothmann P та ін. Передача інфекції 2019-nCoV від безсимптомного контакту в Німеччині. N Engl J Med 2020; 382:970.
  14. Yu P, Zhu J, Zhang Z та ін. Сімейний кластер інфекції, пов’язаний з новим коронавірусом 2019 року, вказує на можливу передачу від людини до людини під час інкубаційного періоду. J Infect Dis 2020.
  15. [ PubMed ][ Cross Ref ]Bai Y, Yao L, Wei T та ін. Ймовірна безсимптомна передача COVID-1 JAMA 2020.

доктора Гельман і Туйт не мають конфлікту інтересів, про який слід декларувати

Leave a Comment